Havbruksfondet fordeler kommunal sektors andel av inntektene fra vekst i oppdrettsnæringen og inntekter fra avgiften på produksjon av laks, ørret og regnbueørret.

Utbetalingene fra Havbruksfondet fordeles med 80% til kommuner og 20% til fylkeskommuner, fra og med utbetalingsåret 2024. Lokalitets-MTB (maksimal tillatt biomasse) for alminnelige matfisktillatelser og tillatelser til særlige formål benyttes for fordelingsnøkkel. Kun lokaliteter for laks, ørret og regnbueørret i sjøvann inngår i fordelingsnøkkelen.

En del av kommunenes andel, tilsvarende 1/8 av midlene som utbetales gjennom Havbruksfondet, kommer til fordeling blant kommuner som har klarert ny lokalitets-MTB innenfor en toårsperiode. Denne utbetalingen er oppad begrenset til 5 millioner kroner per enkeltkommune. Det eventuelt overskytende beløpet fordeles på alle kommuner basert på andel av lokalitets-MTB.